亚号的船长，好友莫尔豪斯曾经共进晚餐。并非是莫尔豪斯在路途与玛丽·赛勒斯特号发电报打过招呼。

在年月日（一些纪录为月日，因为缺乏世纪时精确的时区资讯），玛丽·赛勒斯特号被认识本杰明·布里格斯的大卫·瑞德·莫尔豪斯船长所指挥的德·格瑞第亚号发现。德·格瑞第亚号仅比玛丽·赛勒斯特号要晚天离开纽约港。

德·格瑞第亚号的船员在全速朝向直布罗陀航行的情况下观察它达个小时之久，他们判断玛丽·赛勒斯特号正在漂浮中，虽然它的速度很快而且没有遇难的迹象。德·格瑞第亚号的大副奥利佛·狄佛率领一群船员登上玛丽·赛勒斯特号的甲板，他并且发现船上的状况大致良好，虽然他报告说整艘船非常的湿漉。船上只有一个帮浦（就是水泵），而且在甲板之间充满大量的水。前舱口与活门都是开启的状态，而且只有一艘救生艇下水的迹象，所以他们认为这艘船被故意弃置在海上。一些被广为流传的故事餐桌上摆着没有碰过的早餐与茶、已经洗好的衣物被吊起来晒干、碗里留着吃剩一半的苹果派等传闻都是一本的杜撰。

船上0桶酒精则是原封不动的，虽然当它们全部在热内亚被卸下之后，其中有桶被发现是空的。个月的补给与食物被放置在船上，除了船长的航海日志以外，船上所有的纸张都不见了。航海日志最后记载的日期是月日，当时玛丽·赛勒斯特号在葡萄牙统治的亚速群岛西方00公里的海面上。船上的石版最后显示它将在月日抵达亚速群岛的圣塔玛利亚岛。

德·格瑞第亚号的船员于是将玛丽·赛勒斯特号行驶到直布罗陀，他们在这里则因为表现出的勇气与技术而在听证会受到法官的称赞。但是海军法院的官员福雷德里·克佛伦德从一个简单的救援任务转而怀疑这件事事实上是一项阴谋。最后法院奖赏一些奖金给这些船员，但是整体来说，因为这件事受到怀疑（虽然无法证实），所以报酬远低于他们应该得到的。莫尔豪斯船长则被额外奖励一些货物与奖金。

在许多推测当中，最有可能的推论是船上装载的桶装酒精导致了这次的事件。布里格斯船长在之前不曾载运过这样危险的货物。个渗露出酒精的桶子导致储存的酒精蒸发。历史学家柯瑞德·贝耶斯相信布里格斯船长下令将它们打开，导致毒气与蒸汽暴冲出来，所以船上发生爆炸。布里格斯船长于是匆忙的下令每个人搭乘救生艇，但是没有确保与玛丽·赛勒斯特号之间紧密的相连。而风将玛丽·赛勒斯特号吹离他们搭乘的救生艇，于是他们可能淹死、饿死、渴死或晒死。

其他推论也将事故发生的原因归咎于酒精，不过是以不同的理由。他们认为这些船员想要打破桶子来喝这些酒精，于是杀死布里格斯船长，最后偷走救生艇逃亡。另一个理论则是认为因为布里格斯船长太过残暴，导致船员发生叛乱，所以船长与他的家人被杀，然后他们以救生艇来逃亡。但是根据历史纪录，布里格斯不是这种会造成船员叛乱的船长，大副亚伯·理察森与其他船员也拥有良好的声誉。

另一个推论是指他们遇到了海龙卷，这种情况下玛丽·赛勒斯特号附近的海水可能被龙卷风吸走，导致船只下沉。这种理论可以解释为什么玛丽·赛勒斯特号被德·格瑞第亚号发现的时候会湿透了，也可以说明栏杆受创、破裂的罗盘与消失的救生艇。

不过这些推论都不对，玛丽·赛勒斯特号之所以神秘失踪，跟神秘的的夕照会有说不清道不明的关系——那个时候，正是历史上著名的“花旗国重建时间”，南北战争刚刚结束，国内力量虚弱，痛失殖民地的英格兰王国想要趁虚而入，派出了玛丽·赛勒斯特号，运送了大量的物资，准备支持花旗国内部的反对力量崛起——因为这是一次秘密任务，所以它被伪装成了商船。可花旗国刚刚脱离了英格兰王国的管制，虽然国